PAMAP2 Dataset Loader

`PAMAP2`

PAMAP2データセットに記録されているセンサデータとメタデータを読み込む．

Parameters:

Name	Type	Description	Default
`path`	`Path`	PAMAP2データセットのパス(path/to/dataset/PAMAP2_Dataset").	required

Attributes:

Name	Type	Description
`supported_x_labels`	`List[str]`	ターゲット以外のすべてのラベルのリスト
`supported_y_labels`	`List[str]`	ターゲットラベルのリスト

`load(self, window_size, stride, x_labels=None, y_labels=None, ftrim_sec=10, btrim_sec=10, persons=None, norm=False)`

PAMAP2データセットを読み込み，sliding-window処理を行ったデータを返す．

Parameters:

Name	Type	Description	Default
`window_size`	`int`	フレーム分けするサンプルサイズ	required
`stride`	`int`	ウィンドウの移動幅	required
`x_labels`	`Optional[list]`	入力(従属変数)のラベルリスト(ラベル名は元データセットに準拠)．ここで指定したラベルのデータが入力として取り出される．	`None`
`y_labels`	`Optional[list]`	ターゲットのラベルリスト(仕様はx_labelsと同様)	`None`
`ftrim_sec`	`int`	セグメント先頭のトリミングサイズ(単位は秒)	`10`
`btrim_sec`	`int`	セグメント末尾のトリミングサイズ(単位は秒)	`10`
`persons`	`Optional[list]`	ロードする被験者を指定する．指定されない場合はすべての被験者のデータを返す．被験者は計9名おり，それぞれに文字列のIDが割り当てられている．被験者ID: ['subject101', 'subject102', 'subject103', 'subject104', 'subject105', 'subject106', 'subject107', 'subject108', 'subject109']	`None`
`norm`	`bool`	(beta) センサデータの標準化を行うかどうかのフラグ．この機能はあまり確認ができていないので，使用する際は注意を払うこと．	`False`

Examples:

>>> pamap2_path = Path('path/to/dataset/PAMAP2_Dataset/')
>>> pamap2 = PAMAP2(pamap2_path)
>>>
>>> x_labels = ['IMU_chest_acc1_x', 'IMU_chest_acc1_y', 'IMU_chest_acc1_z']
>>> y_labels = ['activity_id']
>>> subjects = ['subject101', 'subject102', 'subject103']
>>> x, y = pamap2.load(window_size=256, stride=128, x_labels=xlabels, y_labels=y_labels, ftrim_sec=2, btrim_sec=2, persons=subjects)
>>> print(f'x: {x.shape}, y: {y.shape}')
>>>
>>> # > x: (?, 3, 256), y: (?, 1)

Returns:

Type Description

Tuple[numpy.ndarray, numpy.ndarray]

sliding-windowで切り出した入力とターゲットのフレームリスト

x_framesは3次元配列で構造は大まかに(Batch, Channels, Frame)のようになっている． Channelsはx_labelsで指定したものが格納される．

y_framesは2次元配列で構造は大まかに(Batch, Labels)のようになっている． Labelsはy_labelsで指定したものが格納される．

y_framesはデータセット内の値をそのまま返すため，分類で用いる際はラベルの再割り当てが必要となることに注意する．

`load(path)`

Function for loading PAMAP2 dataset

Parameters:

Name	Type	Description	Default
`path`	`Union[pathlib.Path, str]`	Directory path of PAMAP2 dataset.	required

Returns:

Type	Description
`Tuple[List[pandas.core.frame.DataFrame], List[pandas.core.frame.DataFrame]]`	Sensor data segmented by activity and subject.

`load_raw(path)`

Function for loading raw data of PAMAP2 dataset

Parameters:

Name	Type	Description	Default
`path`	`Path`	Directory path of PAMAP2 dataset("PAMAP2_Dataset").	required

Returns:

Type Description

List[pandas.core.frame.DataFrame]

Raw data of PAMAP2 dataset.

Each item in 'chunks_per_persons' is a part of dataset, which is splited by subject.